如何正確高效地使用學術搜索引擎?
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如何正確高效地使用學術搜索引擎
肯定有很多上圖,上數據,上新鮮說法的。
我只補充一句,雖然偏題。學術引擎再怎麼高效,也只是學術做好的第一節台階。
萬事開頭難,其實,萬事第二步也難,第三步也難。走過來以後感覺,每一步都難。倘如此,學術搜索做的再精妙,不能解決學術學習的核心問題。這是大思路,希望不要跑偏,當然,大部分人想跑偏都不得。
舉一例,我認識一同學,這麼說吧,基本上你想要什麼文獻,他都能找到。對於看文獻不多的人可能覺得這樣沒什麼大用,畢竟檢索是找到自己需要的。錯了。一般的自己需要的,你都能自己找到,你再不懂搜索,只要深入讀了一些文獻,你都能找到文獻鏈接,但你可能只找到摘要,而全文找不到如同芒刺在背。
檢索,只是在還沒入門,或者需要進入另一扇門的時候才有大的實用。但檢索沒什麼花樣。無論是sci-hub還是自己學校資料庫,找到檢索詞前五十篇文章下來再加上交叉引用,一個大問題就沒跑了,小問題,十篇高引用文獻,加上其內引用差不多也能找齊了。你還需要什麼呢?
當libgen還能用的時候,我喜歡定一個檢索詞,然後一鍵批量所有相關文獻,然後再預覽模式下看第一頁摘要,不需要,刪,需要,修改標題。
想到再說。
Pubmed可能是醫藥生物專業的同學們最依賴的檢索工具了!作為生物科研狗,已對Pubmed形成了極度的依賴,真的是良心檢索工具,每天學術檢索必用!因為它的存在大大緩衝了翻牆用Google的必要性(不過這項技能仍然很重要)。。。

不能割捨Pubmed的原因,可能主要有下:
1.全免費,有網就能上
2.檢索高效3.可以設置RSS和Alert提醒關注領域的最新進展4.全文地址一目了然(雖然不一定100%全文),有部分開放免費的PMC文章5.能夠高效利用一個工具是很讓人身心愉悅的事,真心無法割捨Pubmed至於缺點也有:
1.文摘資料庫,只提供全文鏈接,並不是總能下載到全文2.無法顯示雜誌影響因子和文章引用率(使用the paper link for pubmed除外)3.偶爾抽風,原因不明……暫時先想分下面分幾個部分寫:
一.基本檢索二主題詞檢索(Mesh詞表)三.過濾器Filter設置四.訂閱功能五.文摘導出……一.基本檢索:
1.1最基本的檢索:
邏輯詞AND OR NOT的使用太基本了,暫不講。需要注意的是,Pubmed里默認空格是AND語句。如果使用片語不想拆分檢索,需使用引號 ""。如:檢索Cancer stem檢索出來的數據量比"Cancer stem"檢索出來的高了一個數量級

1.3 Pubmed將收錄的每篇文獻都附帶一個PMID的編號,每個文獻獨一。所以,只要找到這個PMID號,直接扔進Pubmed檢索框就可以找到想要的文章。
怕有小夥伴找不到位置,還以施院士的文章為例,在文章頁面底下(如圖),能看到PMID編號。
1.4 如果讀文獻的時候看到有好的引文,可以直接找到引文條目後的一大堆數字,直接複製扔進Pubmed搜索框,有極大的概率幫你定位到文獻。再次膜拜NCBI的演算法工程師!
比如第二個Lancet Neurol的文章,將雜誌名及後邊的日期出版號啥的都複製下來,直接扔到檢索框里,搜索簡單高效。
1.6 想整體了解某領域新進展,可以在左側Article types出設定為只檢索Review,方便找需要的綜述。結合下邊要講到的Filter設置,可以快速找到當前領域的經典綜述。

二.主題詞檢索
Mesh詞表為醫學主題詞表。它的好處在於可以將同義詞集合為單個詞來檢索,幫助你檢索全,並排除一些主題不相關的文章。比如,檢索癌症可以查cancer,可以查tumor,也可以查neoplasms。這算少的,而查胃癌還有cancer of stomach;carcinoma of stomach;gastric
cancer;gastric carcinoma;stomach cancer;stomach carcinoma;gastric
carcinoma;stomach cancer這麼多名字,只檢索一個檢索詞容易漏文章。而且這樣檢索有可能會擴大檢索範圍,比如一個講帕金森的文章隨口提了個Cancer就被你檢索出來了,事實上壓根不相關。



Mesh詞也可以直接在Pubmed里檢索,比如檢索"Neoplasms"[Mesh] and p53 「就是在MeSH Neoplasms下檢索包含P53的文章。
需要提醒的是,因為主題詞的設定為人工處理,所以最新的文摘可能還沒有設好主題詞,如果使用主題詞檢索可能會漏過最新最新的文獻。
三 Filter設置幫助篩選文獻
Pubmed最讓人鬱悶的一點就是無法顯示雜誌影響因子和文章引用率,一直聽聞火狐插件the paper link for pubmed可以實現,但我試過幾次不太成功。。。後來放棄了。但Filter功能大大彌補了這一缺陷。首先,你要先有一個NCBI的帳號,這點很重要,並且下邊講到的訂閱功能也需要帳號實現。(註冊網路慢,耐心等待)
先展示下效果:如下,使用了Filter後,可以將全部272條結果篩選出來,影響因子&>5的有82篇,&>7.5的有50篇,&>10分的有20篇,位於神經科學1區的雜誌有19篇。點擊相應的條目就可以只顯示這一部分文章。


四.訂閱功能
Pubmed給各位科研狗們追蹤最新文獻提供了很好的工具,就是自帶的郵箱推送功能。當你開始了某個檢索,查到了相關的文獻,又想隨時跟進,就可以使用檢索框下的creat alert就可以保存該搜索詞,然後設置更新頻率,Pubmed會定期給你郵箱發郵件提醒你文獻更新。比如我們搜一下immunotherapy
五.文獻導出
這個還是直接看Endnote教程吧...最後再說下,任何工具再好都是工具。Pubmed仍有其他功能強大之處,但對我來說基本夠用了。目前按照上邊說的這點小伎倆,已足以讓你找到任何主流的期刊和文獻。如果你在一個小lab,沒有很好的科研經費,沒有很好的老闆,你仍然有機會接觸到最新最好的科研成果!!!
再次感謝NIH每年運營的Pubmed及NCBI其他資料庫,真心感謝。
也向和我一樣仍然苦於求索、熬於浩瀚文獻中的科研狗們致敬意。翻牆google scholar ,根據自己經常關注的關鍵詞建立快訊,谷歌學術會自動按關鍵詞檢索文獻並把結果發到你的谷歌賬號郵箱里。關鍵詞可以是作者,也可以是標題,都可以。
1. 翻牆到google scholar,按照你的專業感興趣的關鍵詞檢索,俺是燒窯的,就搜 ceramic;





一點小技巧吧。1、看到方法論的文章,順手看看被哪些文章引,於是知道這個方法有哪些用處。2、看文獻時稍微留心一下雜誌和作者,看得多了,能自動過濾一些垃圾文章。3、用好谷歌學術中的推送功能,設置好關鍵詞,一些新鮮文章會推送到郵箱。4、在谷歌學術中維護好個人已發表論文,這樣在學術的個人首頁也會收到相關推薦。5、建立一個reseachgate帳戶,維護好個人信息,推送能力不比谷歌差。
有提到說使用過谷歌學術的,那麼就需要通過 iProxier ? 來使用Google了。
先下載領域內最新的review paper
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