意向有機化學全合成方向，請問需要哪些化學軟體（電腦/iOS）？
題主開學大二，某985學生，即將開始有機課題組科研訓練，希望各位大牛指點，需要哪些讀文獻、化結構、計算化學、查資料庫的軟體？感激不盡！
（有沒有可以設計有機全合成路線的軟體？）（為什麼總覺得chemdraw畫出來的結構和文獻里的結構感覺很不一樣？文獻作者們用的是哪種畫圖軟體？）
謝璐瑤姐姐 @Luyao Zou 邀，我來零零散散水一下……
網站注意三個，SciFinder用來查結構和合成路線和反應細節等一系列信息，用谷歌學術來各種查文獻，用sci-hub用來下一些你在Scifinder和谷歌學術查到的但是下不了的文獻。這三個具體怎麼整我不知道怎麼語言描述，好好摸索一下，必須用熟。後兩個有時候會被封，要會找相關的鏡像站。
輔助的網站有Crystallography Open Database和Home - The Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC)，用來查找單晶結構或者上傳你新發現的單晶結構的。
It"s a Free tool by NOUNPLUS英語語法檢測網站，檢測你的學術文章里的語法錯誤。
Chemdraw，基本功能是用來畫結構和合成路線，然而他還有預測結構的核磁啊之類的各種輔助功能，化學工作者必備，好好摸索一下。
MestReNova，分析核磁數據用，也是必備的。你拿到的核磁數據就在這軟體上面打開，用這軟體做看圖、積分、標峰之類的工作。
Mercury，分析單晶數據用的軟體。對於全合成來說，產物的單晶XRD數據是確定你合成的產物結構正確的最強力的表徵，而你獲得的單晶數據就在這個軟體里鼓搗。
Endnote或者Noteexpress，文獻插入與管理軟體。一方面你可以用這個軟體來對你看過的文獻進行記錄和分類，另一方面你可以用這兩個軟體來標註和排列你的引用文獻。插入文獻的時候，你不用這兩個軟體也可以，但如果你引用文獻的量比較大的話，一旦有個頁碼需要修改，你的工作量都會很大，並且你會在調整引用文獻的時候感到生不如死。在這兩個軟體里，我相對傾向於使用Endnote。雖然Noteexpress是中國人搞的東西，更加貼近中國人的操作習慣，但我的實踐操作感覺在bug率和引用文獻格式出錯（比如英文里插入個中文或者格式紊亂之類的事）這倆問題上，Endnote要優於Noteexprss。
PPT，這是個神器，做學術報告就靠這貨了，這方面我不用多說吧，唯一要提醒注意的是做PPT這個事不一定要很華麗，但內在邏輯很重要，這個你看看別人的PPT咋做的學習一下吧。重說三，邏輯，邏輯，邏輯。另外PPT的功能方面，有一個重點是PPT這個東西作圖功能很強大，要會用它來作圖，對於學術工作者來說其實作圖功能很重要的，你看看那些高質量的期刊l文獻，會看到很多很炫酷的圖，作好看的圖是一個必備技能。不過要作好看的圖，除了技能，你需要審美過關，我這種審美爛的人作完圖永遠是被人罵的……
Word要用好，以後寫文章的時候排版功力還蠻重要的，雖然有點遙遠吧，但這個技能的優勢在你以後寫畢業論文的時候會有更加明顯的體現。有人說用Latex排版方便，但我沒用過，不好說啥。順便用Word的時候以及你以後做PPT的時候，最好順手習慣性保留一個PDF的版本，word和PPT直接拷到其他電腦的時候，有時候會變形或者圖像無法顯示的。這個時候PDF的用處就體現出來了。
PS或者其他處理圖片的技能。就你在投文章的時候，會發現有的期刊要求比較嚴，會要求圖片解析度，我們組之前投文章有人就碰到這種情況。我沒碰到這事我就還沒去摸索，但這個技能是你早晚要掌握的。圖像解析度不高的話，這個圖片出現你發表的文章中的時候，別人一想放大看圖片就會一片模糊，影響文章觀感。雖然說出文章還遠，但作圖清晰這個技能，對你用PPT講解你的工作也有作用。作出一張優質的圖片，會在某種程度上體現你工作的嚴謹認真和細緻，這是態度的反映。有人（包括我）喜歡用QQ截圖，但不要用QQ截圖然後另存為的功能，這樣圖片弄出來很模糊的。把截下來的圖剪切粘貼到機子自帶的畫圖軟體上，點裁剪把空白部分去掉，然後在畫圖裡選擇另存為JPG，這樣走個流程弄出來的圖片比直接截圖會清晰很多，不過我不懂原理，不知道為啥這樣圖片弄出來會好。但如果會擺弄PS就更好了。
可能你還需要一個keep或者咕咚運動之類的APP……全合成很耗體力和時間的，要堅持鍛煉，打好底子才能做這行……
最後一個跟軟體沒有太大關係了，就是如何作學術和文獻報告。這個問題在你進組以後總要面對的，就給大家彙報你的工作和針對某個專題作個彙報。這裡面最重要的，感覺還是講解的邏輯和思路。這方面注意觀察你的老師和師兄師姐講解的框架。我提供一種思路：他們的PPT可能做的思路是：背景（這個課題的歷史和可能應用）-現狀（進展到哪一步了及其優勢和困難）-我們為啥做（現在有啥困難以及我們的工作懟爆了哪些困難）-我們做了啥（實驗相關的數據和過程）-我們做成了啥（具體數據和我們工作的意義）。大概這樣吧……以後想到啥再接著扯。
媽呀最近水知乎太多了……我趕緊看文獻去……
大半夜看到這個，我來回答一個，普通211有機化學專業研究生18年畢業，先說chemdraw,一點問題都沒有，把格式改成ACS1996那個就跟文獻差不多了，計算化學沒學過，不懂，再說看文獻，既然想做全合成想必人名反應應該是了解了不少了，至於方向，先看你要進去做的組主要做什麼，然後去搜你導師的工作，等你讀個差不多你也就知道你要做什麼了，想了解有機合成的熱點，看國外幾個大組的工作基本就了解了，查文獻用scifinder這個應該是收錄最全的，至於怎麼設計全合成路線的軟體，恕在下才疏學淺，沒聽過，不過全合成現階段基本上都是你導師設計你做，等你有水平做全合成了，估計也就用不著找軟體來輔助路線設計，突然注意到開學大二這不是才學基礎有機化學嗎？。。。電子效應，立體效應啥的好好學，基礎有機化學，波譜解析，立體化學，這些基礎課學完了再看文獻吧，有空去找找福山的那本機理書刷一刷，嗯想到再補充
軟體都被 @鍾無艷 大佬補充完了，太全面了我插不上話……說說文獻方面吧……
不是全合成方向的，所以肯定沒有 @謝嘉欣 這位大大了解的多
扯點我知道的
全合成方面了解的年輕大佬可以關注一下美國Scripps研究所的Baran教授大佬，同所的神牛華人化學家Jin Quan Yu的好友。
順帶提一下經典一點的兩位老年神牛
K.C Nicolaou(同Scripps所)
E.J.Corey(哈佛大學)兩位早年的經典作品都可以看看這兩位就是在有機研究生的"必修"的named reaction中是作序的大佬。(提一句，《The strategic application of named reaction》這本書可以買下來看看，很推薦)
國內的話，我就說兩個我親自接觸過的吧
一個是北京大學的楊震教授，這位是前面謝師兄的之前老闆
一個是有機所的李昂研究員，應該是楊震教授以前的學生。以前聽過李昂老師的報告，感覺真是很厲害 ……
除了上述的named reaction之外，還可以推薦兩本書，一本書劍橋大學Stuart Warren教授出的，以disconnect為切入的，作為練習冊可以使用的《Designing Organic Syntheses》
一個是《The art of writing reasonable organic mechanism》，書如其名，對個人理解有機反應和機理都有很大的幫助。
這兩本配合上named reaction，相信對你會有一定幫助的chemdrawendnotemercurymestReNovaorigin
不請自來，同開學大二。做有機合成的話chemdraw夠用了。計算的話material studio（建模、優化）、vasp（計算，比其他軟體計算能力強一些）、gausses（分子）。還有很多其他軟體我也不太清楚了……但是，計算門檻挺高，知識儲備要求和硬體要求都高，入門過程漫長...畫圖的話，ppt、origin、ps、coreldraw，畫點複雜的三維的3DMax要好一些。
基本都是chemdraw吧，chemdraw有一個圖標類似於一個小人，可以優化所選結構。
reaxys 這麼好用的東西竟然沒人推薦，新手用最好了
多花時間在實驗室搬磚就好了。。。相信我
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