如何渲染分子結構?
01-28
好吧我直到我關注的點不對...我一定會好好學習可是...這圖裡的結構是怎麼渲染的?為什麼就是這麼好看呢~~能不能從PDB文件達到這樣的效果呢?求大神們指教
圖在這裡:Conformational transitions and stop-and-go nanopore transport of single-stranded DNA on charged graphene : Nature Communications
謝@Milo Yip邀請
我有個系統是用 webgl 做的,物理 brdf 加 ssao,不過那個的數據是從資料庫動態載入的,你要是論文製圖的話找個設計公司,把你分子結構導出成那邊能打開的格式就行了。
用 PyMol 或者 VMD 什麼的導出 obj 文件以後就可以隨便玩了。我一般用 Blender. 過程見我的 blog Sky Watch / Molecule visualization with Blender
這裡從我的另一個回答里挑幾個圖:

場景源文件:https://drive.google.com/file/d/0B9ybmL_hSiV-U2NBQUxCLXJ4ejQ/view


RCSB官方列出的軟體列表:RCSB PDB
其中Gallery ? Bioblender 這個軟體的圖看起來效果也不錯。常用的PyMol自己應該渲染不出這麼好的效果,但PyMol可以導出.obj文件。所以應該用MAYA之類的渲染也可以達到吧。我記得Nature, Sicence的封面圖都是找設計師專門製作的。
AI 軟體
以前關注過這個方面,下面是一些相關資料,geometry - Drawing a sphere in OpenGL ES維基百科:List of molecular graphics systems
Enhancing Molecules using OpenGL ES 2.0
Molecule Visualizer從事3D渲染的人關注下.
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