搞懂一切

02-01

徹底搞清楚promoter, exon, intron, and UTR (有圖有真相)

外顯子、內含子、mRNA、CDS、ORF區別詳解_百度文庫

名詞解釋

靶基因
- 即目的基因。在分子遺傳中，它不僅要具有識別結合功能，還應該具有與位點結合後能表達你所需要的相應功能的作用。
- 順式靶基因：根據基因的位置關係預測．n反式靶基因：預測軟體：ＬｎｃＴａｒ，ｌｎｃｐｒｏ等
- 順勢作用原件作用位點.(順式作用位點)：隻影響處於同一DNA分子上的DNA序列,此性質通常暗示該位點不編碼蛋白質.
- 反式作用因子：指和順式作用元件結合的可擴散性蛋白,包括基礎因子,上游因子,誘導因子.
丰度
- 基因表達的丰度
  - 是指基因轉錄成mRNA的數量。
  - 基因表達丰度高是指該基因轉錄成mRNA多，那麼表達的蛋白也多，對於表型的影響就大。
- 基因丰度
  - 是指基因組中該基因的拷貝數量。
  - 基因丰度高，即這個基因的數量多，那麼可能這個基因的表達量也會多，但是不一定，主要還是要看該基因的啟動子強弱。所以基因丰度高不代表表達丰度也高。
開放閱讀框
- 在分子生物學中，開放閱讀框(Open Reading Frame, ORF)從起始密碼子開始，是DNA序列中具有編碼蛋白質潛能，一段無終止密碼子打斷的鹼基序列。
UTR
- untranslational region,指的是mRNA上5『或3』端的非翻譯區
關於編碼區和非編碼區
- 編n碼區就是一段要表達的DNA序列，而非編碼區的則不被表達，外顯子和內含子是存在於真核細胞中，顧名思義外顯子就是要表達的，內含子是不被表達，它們一般n存在於一段基因中，一般間隔排列。總的來說就是，基因分為編碼區和非編碼區，而在真核細胞中編碼區又有外顯子和內含子。
引物
- 在nDNA的複製過程中需要有一段很小的核苷酸序列來引導另一條鏈的合成，它就是引物，我可以簡單說一下為什麼要有引物，來便於你理解，因為DNA在複製過程n中並不是由一種DNA聚合酶來完成的，我們一般所指的NDA聚合酶就是可以結合在引物上來進行核苷酸的鏈接，它的速度比較快，也有用來合成引物的聚合酶，n但是他的速度很慢，所以就要把它們的優點集合起來就有了引物這個東西。
生物標誌物
- （Biomarker）是指可以標記系統、器官、組織、細胞及亞細胞結構或功能的改變或可能發生的改變的生化指標，具有非常廣泛的用途。生物標誌物可用於疾病診斷、判斷疾病分期或者用來評價新葯或新療法在目標人群中的安全性及有效性。
轉錄水平調控
- 是真核基因表達調控的重要環節。根據真核基因表達是否受環境影響可分為：發育調控和瞬時調控。其中發育調控是指真核生物為確保自身生長、發育、分化等對基因表達按「預定」和「有序」的程序進行的調控，是不可逆的過程；瞬時調控是指真核生物在內、外環境的刺激下所做出的適應性轉錄調控，是可逆過程。
轉錄後調控（post-transcriptional control）
- 真核生物基因活性可以在轉錄水平上調控，也可以在轉錄後對RNA的加工進行調控，即轉錄後調控。
- 包n括:(1)剛轉錄的核內不均一RNA ( nhnRNA)的選擇性加工。運輸到細胞質中翻譯。如海膽的成體腸細胞中，在2500種hnRNA中只有300種形成mRNA; n(2)選擇性剪接，即同一其因轉錄出的RNA通過mRNA前提的選擇性拼接產生不同成熟 mRNA,轉錄後翻譯成不同的蛋白質。
生物分類
- 分類等級包括域（總界）、界、門、綱、目、科、屬、種。在每一級里，都可插入一個亞級。
- 詳細分類
  - 域、界、門、亞門、總綱、綱、亞綱、總目、目、亞目、總科、科、亞科、總屬、屬、亞屬、總種、種、亞種。
  - 三域系統生物分類
    - 真核域
      - 動物界、真菌界、變形蟲界、植物界、有孔蟲界
    - 細菌域
      - 原核生物界
    - 古菌域
      - 嗜泉古菌界、廣域古菌界、初生古菌界[2]
  - 按大小分
    - 生物由原核生物、真核生物及非細胞生物組成，包括動物、植物、細菌、真菌、病毒等，其特徵是可以進行新陳代謝。
    - 動物
    - 植物
    - 微生物
微生物
- （個體難以用肉眼觀察的一切微小生物）
- 微n生物包括：細菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、顯微藻類等在內的一大類生物群體，它個體微小，與人類關係密切。涵蓋了有益跟有害的眾多種類，廣泛涉n及食品、醫藥、工農業、環保等諸多領域。在中國大陸地區的教科書中，均將微生物劃分為以下8大類：細菌、病毒、真菌、放線菌、立克次體、支原體、衣原體、n螺旋體。有些微生物是肉眼可以看見的，像屬於真菌的蘑菇、靈芝等。還有微生物是一類由核酸和蛋白質等少數幾種成分組成的「非細胞生物」，但是它的生存必須n依賴於活細胞。
套索結構
- 通過分析體外剪接反應中形成的中間體，發現內含子是以一種套索結構（lariat structure ）的形式被切除的，即內含子5』端的鳥苷酸依靠2』，5』-磷酸二酯鍵與靠近內含子3』末端的一個腺苷酸連接在一起。
融合基因
- 是指將兩個或多個基因的編碼區首尾相連．置於同一套調控序列（包括啟動子、增強子、核糖體結合序列、終止子等）控制之下，構成的嵌合基因。