除了GEO、TCGA、Oncomine、SEER,還有別的資料庫可以挖掘嗎
04-08
除了GEO、TCGA、Oncomine、SEER,還有別的資料庫可以挖掘嗎?當然是有的。那是什麼資料庫?可以做數據挖掘的資料庫還有很多,我們這裡要介紹的是GDSC資料庫。
第一、GDSC是什麼?
藥物敏感性基因組學項目(GDSC)是Wellcome Sanger研究院(英國)的癌症基因組項目和馬薩諸塞州綜合醫院癌症中心(美國)分子治療中心之間的Wellcome資助的合作項目的一部分。 這項合作將兩個地點的專業知識結合起來,以確定癌症生物標誌物的目標,這些生物標誌物可用於鑒定最可能對癌症治療作出反應的基因定義的患者亞群。

二、GDSC有什麼?
GDSC具有大於1000種抗癌治療藥物的基因特徵人類癌症細胞系, 這些化合物包括細胞毒性化療藥物以及來自商業來源的靶向治療藥物,學術合作者以及生物技術和製藥工業, 細胞系的敏感性模式與廣泛的基因組數據相關聯以鑒定預測敏感性的遺傳特徵。 這種大量的細胞系使我們能夠捕獲人類癌症背後的大部分基因組異質性,並且在確定患者對特定藥物治療的可變反應方面似乎起著關鍵作用。 我們的藥物敏感性數據和遺傳相關性可通過我們的網站免費獲得,作為學術和醫療界的資源。
三、GDSC能做什麼?
1、分析某種基因突變對特定藥物治療特定癌症的敏感性;
2、分析某種基因突變對多種藥物治療特定癌症的敏感性;
3、分析某種基因突變對特定藥物治療多種癌症的敏感性;
4、分析某種基因突變對多種藥物治療多種癌症的敏感性;
5、分析某種藥物在各種基因突變下治療特定癌症的敏感性;
6、分析某種藥物在各種基因突變下治療多種癌症的敏感性;
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